Сведения о доходах работников обособленного подразделения представляются по месту нахождения этого подразделения
Такой вывод Минфин России сделал в письме от 16.12.2011 № 03-04-06/3-348 на основании следующего.
НДФЛ, исчисленный и удержанный с доходов работников обособленного подразделения, должен быть перечислен по месту учета соответствующего обособленного подразделения (п. 7 ст. 226 НК РФ).
Согласно п. 2 ст. 230 НК РФ налоговые агенты представляют сведения о доходах физических лиц в налоговый орган по месту своего учета.
Обязанность налоговых агентов представлять сведения о доходах физических лиц в налоговый орган по месту своего учета корреспондирует с обязанностью уплачивать совокупную сумму налога, исчисленную и удержанную у налогоплательщика, по месту учета налогового агента в налоговом органе.
Таким образом, сведения о доходах физических лиц - работников обособленного подразделения должны быть представлены в налоговый орган по месту нахождения такого подразделения.
Аналогичные вывод финансовое ведомство делало и ранее (см., например, письмо от 21.09.2011 № 03-04-06/3-229).