Если гражданин приобрел статут налогового резидента в течение года, то НДФЛ возвращается работодателем
По общему правилу налоговый агент возвращает излишне удержанный НДФЛ на основании письменного заявления налогоплательщика (п. 1 ст. 231 НК РФ). При этом в п. 1.1 данной статьи указано, что возврат налога по итогам налогового периода в связи с тем, что налогоплательщик приобрел статус налогового резидента, производится налоговым органом.
В Письме от 09.06.2011 № ЕД-4-3/9150 ФНС России пояснила следующее. Если гражданин приобрел статус налогового резидента в течение налогового периода, т.е. до его окончания, то суммы налога за предыдущие месяцы этого периода могут быть пересчитаны исходя из ставки 13 процентов самим налоговым агентом - работодателем. В течение этого налогового периода работодатель также может возвращать НДФЛ.
При этом возврат налога по итогу налогового периода в соответствии с п. 1.1 ст. 231 НК РФ производится налоговым органом.